De schipbreukelingen van de Jonathan vertelt het verhaal van Kaw-Djer, een anarchist in hart en nieren die vindt dat niemand zich moet conformeren. Als op het nabijgelegen eiland Hoste een groep schipbreukelingen aanspoelt, helpt hij hen met het opbouwen van een nieuw bestaan. Wanneer twee van de schipbreukelingen - de Fransman Ferdinand Beauval en de Amerikaan Lewis Dorick, die respectievelijk het communisme en het socialisme representeren - vechten om de macht in de nieuwe kolonie, ziet Kaw-Djer zich genoodzaakt tegen wil en dank de leiding op zich te nemen. Als de rust is wedergekeerd, begint hij een autonoom bestaan als vuurtorenwachter.